第28回 ExCELLSセミナーを開催いたします。
　※本セミナーは日本語で実施されます。Seminar Language: Japanese

日時

2023年3月17日（金） 15:00〜16:30
１．15:00～15:45
２．15:45～16:30

開催形式

Zoomオンライン

演者・題目

1. 海津 一成 博士　（ExCELLS 細胞シミュレーション研究グループ 客員准教授／理化学研究所 生命機能科学研究センター バイオコンピューティング研究チーム 上級研究員）
   ゲノム配列から大腸菌をまるごとモデリングする
2. 渡部 匡己 博士　（理化学研究所 生命機能科学研究センター バイオコンピューティング研究チーム 研究員）
   現象論的細胞モデリング

要旨

　大腸菌は最も良く研究されたモデル生物の一つである。しかし結局、我々はその「大腸菌」というひとつの生命システムをどの程度理解できたと言えるのだろうか？我々は大腸菌を遺伝子発現・代謝・ゲノム複製などの細胞機能を統合し1細胞をまるごとモデリングする「全細胞モデリング」技術を開発している。さらに本研究では、複数の配列解析技術と各種データベースを活用し、ゲノム情報から自動で細胞モデルを構築することを可能にした。これにより、数理的なモデルの詳細を知らなくてもゲノム配列を入力するだけで、1細胞・全ゲノム規模のシミュレーションによってオミクスデータなどの表現型を計算機上で定量的に評価できる。最後に、この全細胞モデリング技術を利用した合成ゲノムの「仮想」実験の例も紹介する。

 

ポスター

 

お問い合わせ先

青木 一洋（定量生物学研究グループ）

当日の様子